MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16A

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021515	ATG	2	6	4	9	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021515	GGT	2	6	106	111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021515	TAG	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021515	TCC	2	6	156	161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021515	ATTA	2	8	167	174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021515	AGG	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021515	AGT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021515	CTT	2	6	313	318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021515	ATC	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021515	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021515	TA	3	6	399	404	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
12	NC_021515	AT	3	6	433	438	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
13	NC_021515	TAA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
14	NC_021515	GGT	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842866
15	NC_021515	TGC	2	6	577	582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842866
16	NC_021515	ACA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842866
17	NC_021515	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
18	NC_021515	T	8	8	682	689	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
19	NC_021515	TTA	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
20	NC_021515	TTC	2	6	796	801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842866
21	NC_021515	T	8	8	813	820	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
22	NC_021515	AT	3	6	822	827	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
23	NC_021515	TTA	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
24	NC_021515	AAG	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
25	NC_021515	TCA	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842866
26	NC_021515	AGG	2	6	906	911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513842866
27	NC_021515	ACC	2	6	924	929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842866
28	NC_021515	AGA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
29	NC_021515	CTT	2	6	974	979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842866
30	NC_021515	TA	3	6	995	1000	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
31	NC_021515	TTTAAA	2	12	1018	1029	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
32	NC_021515	TTA	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
33	NC_021515	TAT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
34	NC_021515	T	6	6	1084	1089	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
35	NC_021515	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842866
36	NC_021515	T	6	6	1160	1165	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
37	NC_021515	ATTA	2	8	1182	1189	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
38	NC_021515	AAT	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
39	NC_021515	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842866
40	NC_021515	CAAC	2	8	1316	1323	50 %	0 %	0 %	50 %	513842866
41	NC_021515	GA	3	6	1337	1342	50 %	0 %	50 %	0 %	513842866
42	NC_021515	ATCT	2	8	1343	1350	25 %	50 %	0 %	25 %	513842866
43	NC_021515	A	7	7	1365	1371	100 %	0 %	0 %	0 %	513842866
44	NC_021515	T	6	6	1471	1476	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
45	NC_021515	T	6	6	1550	1555	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
46	NC_021515	TAA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
47	NC_021515	AT	3	6	1615	1620	50 %	50 %	0 %	0 %	513842866
48	NC_021515	TCTTT	2	10	1699	1708	0 %	80 %	0 %	20 %	513842866
49	NC_021515	T	8	8	1768	1775	0 %	100 %	0 %	0 %	513842866
50	NC_021515	ATTT	2	8	1781	1788	25 %	75 %	0 %	0 %	513842866
51	NC_021515	GGCT	2	8	1813	1820	0 %	25 %	50 %	25 %	513842866
52	NC_021515	AAAG	2	8	1822	1829	75 %	0 %	25 %	0 %	513842866
53	NC_021515	ATAA	2	8	1875	1882	75 %	25 %	0 %	0 %	513842866
54	NC_021515	AAG	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
55	NC_021515	A	7	7	1910	1916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021515	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021515	T	6	6	1981	1986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021515	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021515	T	6	6	2004	2009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021515	T	6	6	2024	2029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021515	GTTA	2	8	2047	2054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021515	AG	3	6	2090	2095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021515	TTTCTA	2	12	2133	2144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021515	CTT	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021515	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021515	AT	3	6	2218	2223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021515	CAA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021515	A	6	6	2314	2319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021515	T	6	6	2347	2352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021515	CCAA	2	8	2395	2402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021515	T	8	8	2406	2413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021515	A	6	6	2440	2445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021515	CCA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021515	T	8	8	2516	2523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021515	CTTT	2	8	2550	2557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021515	AGTA	2	8	2560	2567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021515	TTG	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021515	TTG	2	6	2614	2619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021515	CTTCT	2	10	2667	2676	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_021515	ATT	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021515	TGTT	2	8	2734	2741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021515	TAA	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021515	TTG	2	6	2841	2846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021515	GTTT	2	8	2873	2880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021515	TCA	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021515	CTT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
87	NC_021515	T	7	7	2983	2989	0 %	100 %	0 %	0 %	513842867
88	NC_021515	GC	3	6	3066	3071	0 %	0 %	50 %	50 %	513842867
89	NC_021515	CTGTT	2	10	3080	3089	0 %	60 %	20 %	20 %	513842867
90	NC_021515	TCTT	2	8	3165	3172	0 %	75 %	0 %	25 %	513842867
91	NC_021515	TTTC	2	8	3230	3237	0 %	75 %	0 %	25 %	513842867
92	NC_021515	TTC	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
93	NC_021515	TATC	2	8	3294	3301	25 %	50 %	0 %	25 %	513842867
94	NC_021515	T	6	6	3314	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	513842867
95	NC_021515	A	7	7	3350	3356	100 %	0 %	0 %	0 %	513842867
96	NC_021515	TCT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
97	NC_021515	A	6	6	3369	3374	100 %	0 %	0 %	0 %	513842867
98	NC_021515	GTT	2	6	3384	3389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842867
99	NC_021515	ATT	2	6	3482	3487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842867
100	NC_021515	AAG	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842867
101	NC_021515	TA	3	6	3508	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	513842867
102	NC_021515	TA	3	6	3524	3529	50 %	50 %	0 %	0 %	513842867
103	NC_021515	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842867
104	NC_021515	AACA	2	8	3572	3579	75 %	0 %	0 %	25 %	513842867
105	NC_021515	TAC	2	6	3601	3606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842867
106	NC_021515	ATC	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842867
107	NC_021515	ATT	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842867
108	NC_021515	GTT	2	6	3706	3711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842867
109	NC_021515	A	7	7	3766	3772	100 %	0 %	0 %	0 %	513842867
110	NC_021515	TAT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021515	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021515	A	6	6	4131	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021515	A	6	6	4153	4158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021515	CGTT	2	8	4205	4212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021515	CAG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021515	CAA	2	6	4448	4453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021515	TA	4	8	4520	4527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021515	TAA	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021515	TCT	2	6	4606	4611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021515	T	6	6	4616	4621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021515	TCA	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021515	AGCA	2	8	4725	4732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021515	TCA	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021515	CTTT	2	8	4754	4761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021515	AAT	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021515	A	6	6	4883	4888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021515	TTAG	2	8	4947	4954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021515	CAA	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021515	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021515	ATTT	2	8	5106	5113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021515	AATC	2	8	5167	5174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021515	TTA	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021515	TGA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021515	AAT	2	6	5394	5399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021515	T	6	6	5413	5418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021515	TTG	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021515	ATC	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021515	AGCC	2	8	5527	5534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021515	TAAT	2	8	5715	5722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021515	GGAA	2	8	5798	5805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021515	TGA	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021515	GCA	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021515	GTT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021515	TTG	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021515	A	6	6	6139	6144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021515	GGT	2	6	6191	6196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021515	A	7	7	6242	6248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021515	GACGAA	2	12	6267	6278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_021515	A	6	6	6331	6336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021515	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021515	TTAA	2	8	6405	6412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021515	TTG	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021515	GAT	3	9	6450	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021515	A	6	6	6482	6487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021515	TAT	2	6	6553	6558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021515	TGA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021515	AGC	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_021515	CAA	3	9	6596	6604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_021515	AAAAC	2	10	6684	6693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_021515	TGG	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021515	A	6	6	6820	6825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021515	TTAT	2	8	6842	6849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021515	T	6	6	7030	7035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021515	TCT	2	6	7048	7053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_021515	TAT	2	6	7063	7068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021515	TGT	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021515	GATT	2	8	7177	7184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021515	GTTT	2	8	7215	7222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.